El circuito de Sepang, en Malasia, sede de la penúltima fecha del Mundial de MotoGP, fue escenario de las dos primeras tandas de ensayos y el cambio climático, fue clave para el armado de las primeras posiciones con miras a la clasificación sabatina.
Brad Binder fue el encargado de marcar el mejor registro en la tanda inicial con un neto de 1m59s479/1000, que contrastó con lo hecho por Cal Crutchlow, quien en pista muy mojada por lluvia y en la cual había que acertar con los neumáticos adecuados para girar, lo hizo en un neto de 2m05s710/1000. Esto hizo que se tomara un promedio de ambas tandas y Binder quedara al frente delante de Alex Rins (Suzuki) por 097/1000 y Marc Márquez (Honda) a 144/1000. Uno de los pilotos que quedó fuera de los mejores 10, fue el nuevo líder del certamen Francesco Bagnaia (Ducati), afectado por la lluvia y debera buscar recuperarse en la tercera tanda a disputarse desde las 23.50 (Hora Argentina) de esta noche. Las principales posiciones quedaron de la siguiente manera.
Así quedó la tabla de tiempos combinada
| Pos | # | Piloto | Moto | Vtas | Tiempo | Dif |
| 1 | 33 | Brad Binder | KTM RC16 | 18 | 1’59.479 | – |
| 2 | 42 | Alex Rins | Suzuki GSX-RR | 17 | 1’59.576 | 0.097 |
| 3 | 93 | Marc Marquez | Honda RC213V | 15 | 1’59.623 | 0.144 |
| 4 | 23 | Enea Bastianini | Ducati Desmosedici | 15 | 1’59.875 | 0.396 |
| 5 | 36 | Joan Mir | Suzuki GSX-RR | 16 | 1’59.951 | 0.472 |
| 6 | 89 | Jorge Martin | Ducati Desmosedici | 17 | 1’59.966 | 0.487 |
| 7 | 20 | Fabio Quartararo | Yamaha YZR-M1 | 18 | 2’00.543 | 1.064 |
| 8 | 49 | Fabio Di Giannantonio | Ducati Desmosedici | 15 | 2’00.552 | 1.073 |
| 9 | 10 | Luca Marini | Ducati Desmosedici | 14 | 2’00.733 | 1.254 |
| 10 | 72 | Marco Bezzecchi | Ducati Desmosedici | 13 | 2’00.767 | 1.288 |
| 11 | 63 | Francesco Bagnaia | Ducati Desmosedici | 15 | 2’00.770 | 1.291 |
| 12 | 21 | Franco Morbidelli | Yamaha YZR-M1 | 17 | 2’00.771 | 1.292 |
| 13 | 73 | Alex Marquez | Honda RC213V | 16 | 2’01.015 | 1.536 |
| 14 | 43 | Jack Miller | Ducati Desmosedici | 15 | 2’01.034 | 1.555 |
| 15 | 5 | Johann Zarco | Ducati Desmosedici | 16 | 2’01.048 | 1.569 |
| 16 | 44 | Pol Espargaro | Honda RC213V | 15 | 2’01.200 | 1.721 |
| 17 | 88 | Miguel Oliveira | KTM RC16 | 17 | 2’01.247 | 1.768 |
| 18 | 35 | Cal Crutchlow | Yamaha YZR-M1 | 16 | 2’01.251 | 1.772 |
| 19 | 12 | Maverick Viñales | Aprilia RS-GP | 16 | 2’01.328 | 1.849 |
| 20 | 41 | Aleix Espargaro | Aprilia RS-GP | 5 | 2’01.654 | 2.175 |
| 21 | 87 | Remy Gardner | KTM RC16 | 17 | 2’01.704 | 2.225 |
| 22 | 40 | Darryn Binder | Yamaha YZR-M1 | 10 | 2’01.831 | 2.352 |
| 23 | 25 | Raúl Fernández | KTM RC16 | 16 | 2’01.831 | 2.352 |
| 24 | 45 | Tetsuta Nagashima | Honda RC213V | 17 | 2’02.866 | 3.387 |
