Los pilotos de la división motos, fueron los que más sufrieron hoy las dificultades que presentó la etapa entre San Juan de Marcona y Arequipa, con condiciones muy difíciles de tránsito. Las dunas de Acari, fueron un duro escollo para superar, a lo que se sumó, una zona de mucha niebla, donde prácticamente no se veía a dos metros y el paso por ríos secos y zona de grandes piedras, que dificultaron el acceso de los pilotos a cada zona.
La primera gran novedad, la dio el español, Joan Barreda Bort, uno de los pilotos que viene buscando el triunfo desde hace varias temporadas y que por distintas razones no puede lograrlo. Tampoco será en esta ocasión, porque tuvo un inconveniente al caer en uno de los habituales “ceniceros” de arena, del cual se le hizo muy difícil poder salir con la moto y debió abandonar para luego ser evacuado en helicóptero. Kilómetros más adelante, sufrió una espectacular caída, Walter Nosiglia (h), resultando con doble fractura en el antebrazo derecho, siendo asistido por Franco Caimi y Kevin Benavides, hasta que se hizo presente el helicóptero para trasladarlo. También llegó al sector, su padre Walter Nosiglia, quien decidió abandonar la prueba para acompañar a su hijo. También, sufrieron retrasos en la jornada de hoy, Ricky Brabec y Matthias Walkner, quien se perdió en un sector.
Todas estas alternativas, permitieron que la clasificación cambiara en sus principales posiciones. El francés Xavier De Soultrait (Yamaha), fue el ganador de la etapa con 4h07m42s, superando al chileno, Pablo Quintanilla (Husqvarna) por 15 segundos y completó la trilogía de punta, Kevin Benavides (Honda) a 2m37s. De esta manera, Quintanilla es el nuevo líder entre las motos con 8h34m28s, superando ahora a Kevin Benavides (Honda) por 11m23s y es tercero, Sam Sunderland (KTM) a 12m12s.
Clasificación Etapa 3 – San Juan de Marcona/Arequipa
| 1 | -12 | 018 – XAVIER DE SOULTRAIT (FRA) | YAMAHA | 4h07m42s |
| 2 | -5 | 006 – PABLO QUINTANILLA (CHL) | HUSQVARNA | +00:00:15 |
| 3 | -8 | 047 – KEVIN BENAVIDES (ARG) | HONDA | +00:02:37 |
| 4 | -7 | 004 – ADRIEN VAN BEVEREN (FRA) | YAMAHA | +00:06:42 |
| 5 | -6 | 014 – SAM SUNDERLAND (GBR) | KTM | +00:08:26 |
| 6 | -11 | 002 – PAULO GONCALVES (PRT) | HONDA | +00:09:31 |
| 7 | -13 | 011 – STEFAN SVITKO (SVK) | KTM | +00:10:50 |
| 8 | -16 | 007 – ORIOL MENA (ESP) | SPEEDBRAIN | +00:11:15 |
| 9 | -4 | 003 – TOBY PRICE (AUS) | KTM | +00:14:16 |
| 10 | -9 | 029 – ANDREW SHORT (USA) | HUSQVARNA | +00:15:10 |
Clasificación General Etapa 3 – San Juan de Marcona/Arequipa
| 1 | -4 | 006 – PABLO QUINTANILLA (CHL) | HUSQVARNA | 8h34m28s |
| 2 | -8 | 047 – KEVIN BENAVIDES (ARG) | HONDA | +00:11:23 |
| 3 | -6 | 014 – SAM SUNDERLAND (GBR) | KTM | +00:12:12 |
| 4 | -7 | 004 – ADRIEN VAN BEVEREN (FRA) | YAMAHA | +00:13:29 |
| 5 | -5 | 003 – TOBY PRICE (AUS) | KTM | +00:15:17 |
| 6 | -12 | 018 – XAVIER DE SOULTRAIT (FRA) | YAMAHA | +00:16:52 |
| 7 | -3 | 015 – RICKY BRABEC (USA) | HONDA | +00:18:02 |
| 8 | -2 | 001 – MATTHIAS WALKNER (AUT) | KTM | +00:21:14 |
| 9 | -11 | 002 – PAULO GONCALVES (PRT) | HONDA | +00:25:11 |
| 10 | -10 | 029 – ANDREW SHORT (USA) | HUSQVARNA | +00:29:15 |
Los restantes motociclistas argentinos se ubican: 14°) Luciano Benavides, 47°) Martín Duplessis, 48°) Alberto Ontiveros, 74°) Fernando Hernández, 79°) Sebastián Urquía, 97°) Matías Notti.